Auf Panství Bechyně wird die Erntearbeit mit dem Ziel durchgeführt, die qualitativ hochwertige Entwicklung der Waldbestände und eine ausgewogene Vertretung der Altersklassen sicherzustellen. Es gibt verschiedene Arten der Holzernte, die jeweils spezifische Ziele verfolgen. Die Erziehungsernte konzentriert sich auf die Steigerung der Stabilität, Widerstandsfähigkeit, Qualität und Artenvielfalt des Waldes im jüngeren Alter, während die Verjüngungsernte dazu beiträgt, die natürlichen Erneuerungsprozesse des Waldes rechtzeitig einzuleiten, wobei die neuen Bestände widerstandsfähiger, qualitativ hochwertiger und artenreicher sind als die älteren Bestände.
Ein weiteres wichtiges Ziel der Holzernte ist die Beseitigung von kranken, beschädigten und von Schädlingen oder Krankheiten befallenen Bäumen, um deren Ausbreitung auf gesunde Bäume zu verhindern. Die Ernte wird immer in Übereinstimmung mit den geltenden gesetzlichen Vorschriften und der Strategie einer nachhaltigeren Forstwirtschaft durchgeführt.
Die Holzernte auf Panství Bechyně erfolgt durch externe Auftragnehmer, wobei Harvestortechnologien sowie die traditionelle Erntemethode zum Einsatz kommen. Ein erheblicher Teil des Holzvolumens, bis zu 25 %, wird mit Hilfe von Pferden transportiert. Das jährliche Erntevolumen liegt bei etwa 36.000 m³. Panství Bechyně legt großen Wert darauf, dass die Holzernte auf eine schonende Weise durchgeführt wird, die die Gesundheit der Waldbestände und die natürlichen Prozesse im Waldökosystem erhält.